葉綠素是植物光合作用色素，主要有 chla chlb ， 不溶于水 ,可溶于酒精.丙酮和石油醚。葉綠素是葉綠酸的酯，葉綠酸是雙羧酸，其中一個羧基被甲醇酯化，另一個被葉醇酯化，能發(fā)生皂化反應(yīng)。葉綠素 分子含有一個卟啉環(huán)的“頭部”和一個葉綠醇 （ 植醇， phytol） 的“尾巴”。卟啉環(huán)中的鎂原子可被 H ＋、 Cu2 ＋、 Zn2 ＋所置換。用酸處理葉片， H ＋易進入葉綠體，置換鎂原子形成去鎂葉綠素，使葉片呈褐色。去鎂葉綠素易再與銅離子結(jié)合，形成銅代葉綠素，顏色比原來更穩(wěn)定。人們常根據(jù)這一原理用醋酸銅處理來保存綠色植物標本。
葉綠素儀可以獲得同其它用于活體檢測環(huán)境中葉綠素檢測的商品化熒光計相同的準確度。如果用戶根據(jù)標準方法收集水樣，進行細胞破碎，用分光光度法或HPLC對萃取的葉綠素進行測定，測量結(jié)果的準確度將會好于使用便攜式葉綠素儀進行的測量。? 活體測定的相對準確度將會*取決于用戶使用的校準方法（見下一問題）。無論使用了哪一種校準方法，葉綠素儀的讀數(shù)將會近似地追蹤被分析的環(huán)境水樣中的葉綠素變化趨勢。例如，如果用戶使用傳感器，并以一個標準的采樣間隔（15分鐘）為間隔讀取讀數(shù)，葉綠素數(shù)據(jù)的變化 通常反映出一段比較長的時間內(nèi)，該地點浮游植物的增加或減少。如果用戶對相同水體的數(shù)據(jù)點進行水平或垂直繪圖，那么傳感器輸入通常將會顯示出在不同采樣地點浮游植物存在的多或少。以下的圖表示了在不同地點用和一臺高品質(zhì)單參數(shù)商品化熒光計的葉綠素變化曲線。
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